在海南自由贸易港的政策制度体系中，特殊的税收制度被赋予了更重要的地位。

　　中共中央、国务院印发了《海南自由贸易港建设总体方案》(下称《总体方案》)，《总体方案》明确提出，以特殊的税收制度安排、高效的社会治理体系和完备的法治体系为保障，在明确分工和机制措施、守住不发生系统性风险底线的前提下，构建海南自由贸易港政策制度体系。

　　中央关于方案，对海南自贸港税收制度作出高度概括，明确提出：“按照零关税、低税率、简税制、强法治、分阶段的原则，逐步建立与高水平自由贸易港相适应的税收制度”。对于零关税、低税率、简税制这三个关键词，有关方面进行了以下解读。

　　1.零关税

　　根据方案精神，将来海南自贸港实行封关运作。在海南岛与我国关境外其他国家和地区之间设立“一线”，在海南岛与我国关境内的其他地区之间设立“二线”，实行“一线放开，二线管住”的海关监管政策。

　　全岛封关运作前，对岛内企业生产需要的生产设备，实行“零关税”负面清单管理;对岛内进口各类用于营运的交通工具，实行“零关税”正面清单管理;对岛内进口用于生产自用或加工出口的原辅料，实行“零关税”正面清单管理 ;对岛内居民进口的消费品，实行“零关税”的正面清单管理。对实行“零关税”和商品，免征进口关税、进口环节增值税和消费税。离岛免税购物额度增至每年每人10万元。全岛封关运作、简并税制后，除进口征税目录以外，所有进入自贸港的商品免征进口关税。

　　对于进入“二线”的商品，原则上按规定办理相关手续，照章征收关税和进口环节税。对鼓励类企业生产的不含进口料件或者含进口料件在岛内加工增值超过30%的货物，经“二线”进入内地免征进口关税，照章征收进口环节增值税、消费税。

　　2.低税率：分为企业和个人

　　企业方面，财政部与税务总局联合发文明确，企业所得税优惠政策包括三项，自2020年1月1日至2024年12月31日，一是对注册在海南自由贸易港并实质性运营的鼓励类产业企业，减按15%征收所得税;二是对在海南自由贸易港设立的旅游、现代服务业、高新技术产业企业新增境外直接投资取得的所得，免征企业所得税;三是对企业符合条件的资本性支出，允许在支出发生当期一次性税前扣除或加快折旧和摊销。

　　个人方面，个人所得税政策规定，自2020年1月1日至2024年12月31日，对在海南自由贸易港工作的高端人才和紧缺人才，其个人所得税负超过15%的部分予以免征，同时明确了享受优惠的所得范围等。高端人才，指年收入达到30万元以上，或者为海南人才管理部门认定的人才;紧缺人才，指符合海南自贸港行业紧缺人才目录范围，一是旅游业、现代服务业、高新技术产业三大主导产业和热带高效农业种业、医疗、教育、体育、电信、互联网、文化、金融、航运等重点领域技能技术骨干和管理人才;二是海南省机关事业单位人才及法定机构、社会组织聘用人才;三是符合《外国人才来海南工作许可管理服务暂行办法》相关标准的外国人才;四是在海南自贸港执业的港澳台人才;五是海南其他非限制性准入行业领域急需的技能技术骨干和管理人才。

　　3.简税制

　　方案提出，结合税制改革，探索简并税制，改革税种，降低间接税比例，目标是建立税种简单科学、税制充分优化、税负明显降低、财政收支均衡的税负制度。考虑在全岛封关运作的同时，依法对现行增值税、消费税、车辆购置税、城市维护建设税及教育费附加等税费进行简并，启动在货物和服务零售环节征收销售税相关工作。